学院师资力量雄厚，截止到2022年10月，学院全职教职工130人，其中专职教师108名，其中，教授27名、副教授47名、高级实验师3人，博士生导师20人、硕士生导师104人，35%专任教师具有一年以上海外留学或访学经历；先后柔性引进国内外大学、科研院所的院士、讲席教授8人。

学院现有全职国家知名专家领军人才1人，省知名专家获得者、省青年知名专家、省学术技术带头人（含后备人选）、省教学名师等9人，省现代农业产业技术体系首席专家1人；拥有国家重点领域“稻麦绿色增效创新团队”、教育厅“农业资源与农产品化学结构解析及高效利用团队”“农产品中农药残留控制关键技术团队”、省委组织部“115”产业创新团队“农药残留分析与农产品质量安全控制”“巢湖面源污染防治”等5个国家和省部级创新团队。

学院现有国家农业科学合肥观测实验站、农业农村部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（合肥）、农业农村部合肥农业环境科学观测实验站、农产品质量安全安徽省重点实验室、农田生态保育与污染防控安徽省重点实验室、安徽省绿色磷肥智造与高效利用工程研究中心、江淮耕地资源保护与生态修复重点实验室（共建）等国家级、省部级平台11个。建有长江经济带磷资源高效利用与水环境保护中心，聘请张福锁院士担任中心主任。学院同时作为学校绿色发展研究院、智慧农业研究院重要依托单位。